新冠疫情造成全台211名兒童重症，其中32名孩童死亡，而備受矚目的新北市2歲男童恩恩事件，為台灣首例兒童染疫死亡個案。
衛福部長薛瑞元說，新冠疫情期間燒出「台灣兒童醫療網脆弱」嚴重問題，醫療人力根本無法應付出現大量、緊急需求，更憂心10年若孩童出現重症「得跑到國外就醫」。
他表示，先前規畫11億元經費建構兒童醫療網，但現在要擴大經費，強化兒童醫療網，務必一個也不能少。
薛瑞元今天出席由中華民國兒童健康聯盟舉辦的「新冠肺炎COVID-19對兒童及家庭之影響」研討會，透露新冠疫情「終於看到有要漸漸結束的跡象，走到最後一段」，接下來復原工作，尤其兒童部分，包括線上上課、兒童感染是否留下後遺症，還會持續挑戰，縱然疫情結束，這些問題還會存在一段時間，要各領域專業夥伴面對跟解決。
薛瑞元說，行政機關也因為這次疫情，看到很多兒童醫療資源不足的問題，從過去資料來看，很多區域級醫院兒科「幾乎棄守」，剩下少數門診、住院能縮盡量縮，不要說重症單位，連一般病床「都縮到快無法運作」。
他說，因為病床縮、人力跟著縮，根本無法應付突然出現大量、緊急的需求，其他科別的醫護人員要突然來幫忙，幾乎很困難，像是一個孩子要打針，至少要4到5人，一般病房護理師哪有辦法處理？這是一個很大的問題。
談及新冠疫情造成兒童感染重症問題，薛瑞元說，感謝此次兒科醫學會協助，透過線上課程分享，讓台灣不至於發生更多兒童重症或生命損害，因為有現代科技，但也凸顯說，未來若碰到不是新冠肺炎傳染病，若出現其他重症時，還能透過這種方式處理嗎？用視訊網路把知識傳出去就可以做到嗎？
薛瑞元憂心，雖然大家合力可以很快解決問題，但是否每一家醫學中心「都有能力單獨處理兒童罕見重症？」從此次疫情看來，「兒童醫療網可能是脆弱的」，因此在他上任時向媒體透露，除了健保、疫情之外，他要「加強兒童優化兒童照顧醫療網」，要把這建立起來，這就是現有計畫再優化。
薛瑞元說，醫事司向他報告，現有三項兒童醫療優化重點：
第一，建立核心醫院。核心醫院要有能力去處理非常難的兒科疾病，同時負責訓練能夠處理重症、難症的醫師，這是核心醫院角色。醫院不一定每個項目次專科都能做到這點，幾家核心醫院可以談妥後各自去發展。
第二，必須處理急症。例如早產兒需要加情「可近性」，衛福部會在每個縣市成立一家專責醫院，這家要有足夠人力處理兒科急症，不要因為轉送、耽誤病情，原本可避免的死亡，最後讓孩童死亡或變成障礙。
第三，希望建立基層的幼兒專責醫師，從小孩出生就要指定一位專責醫師，長到成人的這段時間定期追蹤健康狀況、疫苗施打，一旦漏掉馬上藉由通報系統找小孩，務必一個也不能少，都能把他接下來。
薛瑞元說，當時醫事司報告「僅編列11億預算」，無奈嘆「這種預算到行政院，會被主計處打回，要我們用自己的預算盈支就好」，後續要求醫事司重新修正計畫、範圍擴大且盡速進行，預算經費可能會很高，「沒關係，預算我來跟行政院爭取」，因為這件事非常重要。
他表示，若沒有做好，憂心過了10年，台灣會出現一種問題，「兒童得到某種重病，得到國外就醫，因為台灣醫師無法處理，老醫師都退休，沒有年輕醫師可以做」，這是「國安問題」。希望應維持醫療量能，可以處理急、重、難、罕病，雖目前還沒要成立兒童司，但要先把前面這些事做好，包括與社政單位聯繫，成立兒童專責單位，基礎的事情得先處理。
台灣兒科醫學會理事長李宏昌表示，過去認為兒童不太會得新冠疫情，但從新北恩恩事件來看，撇除政策問題，發現兒科醫師不會處理，因此當時跟醫事司、疾管署合作，開啟全台兒科醫師線上看診，全台灣兒科醫師一同減輕大醫院急診負擔；此外，當時出現很多兒童腦炎，在疾管署協助下，又開了六場線上直播，邀請全台專家分享，希望兒童問題應在急診先處理，不要等到進病房才做。
中華民國兒童健康聯盟榮譽理事長、台灣大學名譽教授呂鴻基表示，台灣兒童少子化問題嚴重，在全世界排名與南韓差不多，「一個孩子都不能犧牲」，而新冠疫情造成國內32個孩子死亡，「這算多，還是少呢？」
呂鴻基說，台灣行政單位很可惜，雖然衛福部社家署、國健署、醫事司很多單位在管，但沒有兒童專責單位，因此結果不是很好，「少子化說了很久，但政策進步很少，應該要再進步」，呼籲國家應該要有兒童專責行政單位，監察院應該成立專責委員會，國家應該成立兒童醫療研究專責單位，要了解有哪些國家做兒童醫療做得很好，我們應跟著改善、繼續研究。
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