癲癇與自閉症兩者雖然都是從兒童期就會出現的腦部疾病，但是一個在小兒神經科就醫，一個在兒童精神科看診，加上兩者在病症上的外顯表現完全不同，很難讓人把他們聯想在一起。「癲癇」是陣發性腦部放電異常，多以藥物治療為主；「自閉症」屬於神經發展障礙，牽涉到中樞神經系統及神經心理的發展過程上，一旦出現遲緩或異常的神經發展障礙，通常會影響到語言、社交、情緒、行為控制。
有關自閉症在癲癇個案的發生率，第一個研究報告是2005年美國學者根據一個三級癲癇門診中心追蹤的癲癇個案，發現高達32%癲癇患者有自閉症的診斷。2010年日本學者則是在4家醫院的519名癲癇個案中，診斷出15.2%同時有自閉症，其中46.8%是在癲癇發生之後才診斷出自閉症。
近年最值得重視的報告則是來自2016年瑞典完整的全國性世代研究，在癲癇個案中有1.6%診斷有自閉症。
臺灣的研究以1997-2008年健保資料做分析，也發現18歲以下有癲癇診斷隨後發生自閉症的風險比為8.4，有自閉症診斷隨後發生癲癇的風險比亦為8.4，皆比對照組高許多。
從上面的研究觀察發現，這兩個疾病彼此均會增高另一疾病的發生風險，正如以往醫師常會提醒自閉症的個案要小心癲癇發生，而癲癇的個案也應該要注意自閉症的可能存在。
癲癇與自閉症這兩種疾病除了可能同時存在外，其間也有很多異同值得探討，如果考慮病因上的遺傳、神經機制，必然有更多的謎題待解。
最後提醒對於癲癇兒童除了提供適當充足的癲癇治療照顧之外，務必瞭解評估其自閉症相關的症狀，及早予以介入。
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