癌症精準治療須透過基因檢測確認是否有相對應的標靶藥物，甚至預測是否可能發生其他癌症。不過不是每位癌患都願做基因檢測，醫師表示，即使基因突變有對應藥物，也可能受限於適應症無法使用；而有些家族遺傳基因已知和癌症高度相關，但國內現階段對於預防性切除還沒有共識，檢測結果反而可能造成患者恐慌、醫師困擾。
台北長庚乳房外科助理教授級主治醫師郭玟伶表示，長庚與台大醫院曾進行問卷研究，針對乳癌患者或是家屬，先完成基因檢測的說明與諮詢後，詢問「哪些問題可能會構成檢測的困難」約卅％的患者礙於「費用」，約八十％表示「得知結果後不知該怎麼面對」。
台灣乳房醫學會理事長曾令民表示，癌患基因檢測後，若藥物適應症僅侷限在某些癌種，那適應症外使用是否要給付，必須審慎考量。
衛福部次長石崇良也舉例，乳癌患者若檢測出肺癌突變基因，照理說要使用肺癌藥物，但該藥物的適應症是肺癌不是乳癌，這就屬於適應症外使用，這就是個人化醫療要面對的問題。
至於家族性癌症遺傳基因檢測，台大醫院外科部暨乳房醫學中心主任黃俊升認為，醫師和民眾都還沒做好準備，他舉例一位卅多歲的「健康人」因家族乳癌做基因檢測，結果發現帶有突變基因想切除兩側乳房。黃俊升一度懷疑她是否在正常心理狀態下做決定，過去甚至會轉介精神科協助確定精神狀態；他也有一位朋友的母親卵巢癌後又胰臟癌，但胰臟並不像乳房可以預防性切除，就算知道基因突變又怎樣。
台北癌症中心副院長趙祖怡則認為，知道基因突變後能做的是密切追蹤，他曾有一位女病患，廿九歲罹患乳癌、卅六歲肺癌、卅七歲時腎癌、四十一歲顱底癌，正因定期監測，在癌症一發生就治療，所以幸運存活。
三軍總醫院一般外科教授主治醫師俞志誠也說，曾有患者帶有ＢＲＣＡ１基因，罹患乳癌十五年後又胰臟癌，也曾有人得乳癌後又罹患黏液肉瘤，檢測發現帶有ＴＬＥ１基因突變，若能及早發現帶有突變基因，應可做預防性介入。
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