疫情改變國人就醫行為，也讓部分診所賠錢。健保資料顯示，相較前年同期，去年前三季就醫人次減少一九四一萬，預估整年將減少超過二千萬人次。
其中西醫基層診所減少一四七九萬人次居冠，降幅達百分之十，且連續三季未見止血，兒科、耳鼻喉科等診所叫苦連天，就醫人數大降三、四成，部分診所賠錢，只好減診、縮編，甚至向銀行貸款。
健保統計，西醫基層給付點數較去年減少三十二點二億點，跌幅驚人。分科別來看，去年前三季以小兒科、急診科、復健科就醫人次下降最多，分別較前年同期少百分之二十一點六、百分之十五點二、百分之十二點八。其中小兒科最慘，第一季就醫人次比去年少百分之十三點一，第二、三季較去年慘跌百分之三十一點二、百分之二十點三。
基層醫療協會理事長林應然表示，小診所每月房租至少五萬，加上護理人員、藥師、行政人員等人事成本，以及水電、清潔、藥品等固定支出，每月營運成本三十萬起跳，如果每個月病人少於一千人，診所醫師等於沒收益，已有不少診所虧損連連，甚至必須向銀行貸款。
考量去年醫療院所收入不理想，健保署修訂醫療產業紓困辦法，正報請行政院核定。
健保署醫務管理組副組長吳科屏表示，通過後，若院所去年一月到八月健保醫療費用低於前年同期的八成者，將獲得補助，確保達到前年同期八成。目前粗估一千七百多家醫療院所可獲得補助，經費約四億元，將由紓困振興特別預算支應，不會用到健保公務預算或保險經費。
衛生福利部健保署署長李伯璋表示，過去一年狀況特殊，民眾畏懼就醫，但醫療體系提供醫療服務並未打折，也沒有出現就醫障礙。不過，民眾也學習到不需要逛醫院，未來或許有助於各級醫院就醫人數正常化，讓醫院不再那麼血汗，提升醫療點值。
衛福部部長陳時中於去年初承諾醫療院所補助八成，林應然呼籲，衛福部盡速提供紓困，讓部分院所得以週轉、度過難關。
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