菇類目前栽培的方式若以栽培介質區分，主要可分為段木栽培、堆肥栽培、木屑太空包或瓶栽模式等，而國內目前香菇栽培主要是以太空包與段木栽培為主。
段木香菇 具獨特香氣口感
新竹縣芎林鄉鹿寮坑段木香菇農場的老闆田日財表示，段木栽培需要先截取長約130公分、直徑9到18公分的原木，並在原木上打孔植入菌絲，再將段木豎起，讓菇類吸取木頭中的木素質作為養分自然生長，而段木可採用楓香、相思樹等闊葉木，不同樹種種出的香菇品質也不同，農場採用的則是相思木。
農業試驗所菇類研究室助理研究員呂昀陞指出，段木栽培為1980年代前香菇主要的栽培模式，但由於段木香菇栽培時間較長，光是養菌期就需要5至8個月，且耗費的勞動力較高，加上產量較低，因此漸漸被太空包香菇所取代。不過，段木香菇具有獨特的香氣與口感，因此至今仍有許多消費者喜愛。
太空包香菇 國內栽培主流
而目前主要的栽培方式太空包，則是以木屑加入米糠、玉米粉等材料混合作為培養基質，再將混合好的材料裝進耐高溫又有伸縮性的聚丙烯塑膠袋，用塑膠環套住袋口並塞上棉花，接著用高溫殺死雜菌，再將菌絲移入太空包中。
太空包栽培養菌時間大約需3至4個月，由於操作比段木香菇方便，也更節省勞動力，加上單位面積產量較段木香菇高，因此成為目前國內栽培的主流。
營養無差異 胺基酸略有不同
民眾可能會好奇用不同栽種方式種出來的菇類，在營養上是否有差異？對此，呂昀陞表示，段木香菇與太空包香菇兩者的營養價值，在目前國內外的研究報告皆顯示，兩種栽培模式產生的菇體營養價值並未有顯著差異，但兩者在胺基酸的組成結構上與含量上有些微差異，有可能是造成段木香菇具有獨特香氣的原因。
菇類的香氣除了受種植方式影響外，其實不同季節種出來的菇類也會影響香氣及口感。田日財表示，一般常聽到的冬菇，指的就是在冬天生長的菇，菇類在冬天時因生長速度較慢，養分儲存更豐富，菇肉厚實飽滿，口感更有嚼勁，香氣也更濃郁，顏色也比夏菇來得深，因生長慢、產量少，價格就比夏菇貴。
多數香菇 無化肥用藥疑慮
由於現代人越來越注重養生、食品健康，許多民眾在購買蔬菜時會特別挑選有機蔬菜，但菇類是否也需要買有機的？
呂昀陞則指出，根據我國目前農產品生產及驗證管理法的規範，有機農產品須經過第三方認證單位驗證後方可標示為有機農產品，在菇類栽培上，一般農友會認為只要不使用農藥即為有機栽培，但其實這與目前的法規不相符。
不過，由於菇類栽培過程中不需要使用化學藥劑與肥料，因此多數農友生產的香菇都屬於安全與健康的香菇，民眾不需要過於擔憂，若仍有疑慮，也可選購通過生產履歷認證的菇類。
菇的保存
鮮菇擺冰箱 記得開洞透氣
買回家的菇類該如何保存？田日財表示，保存方式依照生鮮香菇與乾香菇有所不同。
生鮮香菇：可用塑膠袋裝著放冰箱，但千萬要記得讓菇類保持透氣，因菇類會釋放水氣及二氧化碳，塑膠袋口必須打開，或是在塑膠袋上戳洞保留一些通風口，才能防止香菇氧化、發酸。
乾香菇：易受潮，因此須放在夾鏈袋、密封罐等可緊密封口的袋子或容器內，防潮、保持乾燥，也能避免香味散掉。乾香菇不一定要貯藏於冰箱，放在常溫避免陽光直射處也可以，只不過放冰箱保存期限較長。若發現香菇有受潮情形，也可在乾燥晴朗天氣，將香菇放置在戶外曬太陽，以免發霉長蟲，且日曬後的香菇，更有助於補充維生素D。
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