目前全台約180萬人感染B肝，其中六成進入不活動性帶原，另有四成，大約70萬人，則可能因引起反覆性肝炎需抗病毒藥物，健保給予固定療程的給付。近十年來，國人死於慢性肝炎及肝硬化、肝癌的人數顯著下降，顯見目前健保給付可稱合理，但最近學界因B肝健保給付條件是否應適度放寬，進行專家辯論。
B肝屬免疫疾病 可先觀察
所以，B肝患者不同於愛滋病或C肝患者，後兩者屬病毒疾病，治療原則為只要有病毒存在，就必須藥物治療。反之，B肝屬免疫疾病，當患者發生肝功能（ALT或GPT）上升，臨床應觀察三個月，判斷宿主有無機會產生自發性免疫病毒清除，肝臟雖然發炎，卻不需急著治療。
長期服藥 應告知利與弊
目前B肝口服抗病毒藥物，僅抑制病毒繁殖，無法有效清除存在肝細胞核內的病毒基因（cccDNA），可以斬草，卻無法除根。反觀宿主的免疫功能，是目前清除cccDNA的唯一利器，在健保規範下經固定療程後停藥，若肝炎復發，剛好給宿主根除B肝病毒的機會。
抗病毒藥物治療的終極目標為B型肝炎表面抗原（HBsAg）消失，即幾近痊癒。但要長期服藥到HBsAg消失，每年的機率僅0.2%，10年約2%。醫師如果強力建議病人長期服藥，而未告知利與弊，則有剝奪病人提早達到HBsAg消失的疑慮。
自2003年起，健保開始有條件給付B肝抗病毒藥物，目前規範，e抗原（HBeAg）陰性患者可接受口服抗病毒藥物治療三年，治療中需驗三次B肝病毒（HBV DNA），每次間隔六個月，若均為陰性即可停藥。
停藥後，一年內有21%可維持肝功能正常及有效抑制病毒，每年有6%HBsAg消失；19%病毒復發但肝功能正常，不需治療，每年也有2.2%達到HBsAg消失。
另外，有22%肝功能上升及病毒復發，但暫不治療，每年有3.2%達到HBsAg消失；39%選擇繼續藥物治療，每年卻僅有0.2%達到HBsAg消失，值得大家重視。
研究：固定療程療效較優
大家擔心，停藥後一旦肝臟發炎，會發生肝臟代償不全甚或肝衰竭。但根據國內外統合性文獻發表（證據等級第一級），其機率均小於1%，因而死亡病例更少，後者可經由規律且密集追蹤和及時治療來減少其發生。
最近台大研究指出，在非肝硬化患者，固定療程與長期用藥相較，五年肝癌發生率分別為1.3%與2.2%，兩組均無發生肝臟代償不全，HBsAg消失的機率為8%與0；長庚研究也顯示，在非肝硬化患者，固定療程六年肝癌的發生率為1%，無人肝臟代償不全，HBsAg消失機率六年為16%。
反觀肝硬化患者，其五年肝癌發生率，固定療程為7.5%，長期用藥卻達12.5%，發生肝臟代償不全分別為3.7%與5.8%。由此來看，比起長期用藥，固定療程有優越的安全性及療效。目前固定療程的藥物治療，確實大幅提升HBsAg消失機率，已引起歐洲肝臟研究學會及美國肝臟研究學會重視，並加入相關B肝治療指引。
28萬人不知自己染B肝
關於B肝治療，醫師的責任是治療要及時，可減少大部分的B肝代償不全，且治療勿躁進，可達成B肝幾近痊癒的最大化。病患的責任是遵守醫囑，勿擅自停藥或停止追蹤。目前約28萬人不知自己是B肝感染者，這是B肝防治最大鴻溝，必須藉由篩檢弭平，政府的責任是找出這些患者接受追蹤及治療，如此則三贏，可在2030年達成消滅B肝的神聖使命。
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