隨著大醫院被搶著PCR核酸檢測的民眾擠爆，疫情指揮中心希望地方診所能協助分擔壓力，設立PCR採檢站、視訊居家照護等，基層診所透露「採檢站根本就是嫌惡設施」。
以台南來說，目前參與的很多是新冠疫情下的「重災戶」，包括小兒科與耳鼻喉科診所，因為營收大減，不得不硬著頭皮加入指揮中心計畫，其他的診所則興趣缺缺或仍在觀望。
台南市醫師公會理事長陳相國表示，台南市目前願意加入確診者居家照護的基層診所約有150到200家，而願意做核酸檢測的則有十多家，確實後者比較困難，但是隨著疫情不斷變化，以快篩取代PCR是趨勢，未來少數的人才要做PCR，應該現有的大醫院量能就能滿足需求，不需診所再協助。
「之前連民眾要來做快篩都被抗議，如果要做PCR可能會被罵死」台南市北區一名診所醫師表示，診所有疾管署配給的公費快篩，針對有症狀或有接觸者可以前往免費索取篩檢，依規定醫師必須要看著病人篩檢，但是診所裡平常都是一般的患者，「看到有人在你旁邊戳鼻子你不會嚇死嗎」，只好讓患者去診所外篩，但卻又被左鄰右舍抗議，現在指揮中心又要診所協助分擔醫院的PCR量能，但都會區裡的診所真的有困難。
這名醫師表示，不可能在診所內採檢，與一般病人混在一起，如果診所內沒有其他空間，就只能像大醫院一樣在戶外搭棚，但又會被鄰居抗議，醫師即使想配合也力有未逮。
中西區一名診所醫師也表示，確診者居家照護目前逐漸下放給診所醫師，台南市參與的100多家多數是小兒科與耳鼻喉科，在這一波疫情之下，病患數量大幅減少，可能是他們比較願意參與居家照護的原因之一，其他的醫師因為擔心影響到一般的看診，多數還在觀望中。
一名未加入居家照護的醫師表示，有關抗病毒藥物，中央目前正在徵求基層診所中，初步以有做居家照護及PCR採檢的診所優先，但地方上做這些特別是後者的診所意願相當低，而且雖然衛生局會將確診者居家照護配給醫師，但病人可能原先有熟悉信任的醫師，而非加入居家照護的醫師，希望中央也能開放給予抗病毒藥物給一般診所。
此外，基層醫師也希望能夠有一定數量的血氧機配發給地方，讓有風險的居家照護者能夠借用，避免突然血氧降低死在家中的風險。陳相國表示，台南市衛生局已在規畫中，未來應該可以借用。
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