病人自主權利法昨實施，醫界、學界認為有五大問題尚待解決，包括代理人決定權是否優於患者，如何判斷心智缺損是不可逆等，都可能影響患者未來權益。
中央研究院法律學研究所副研究員吳全峰說，病主法與安寧緩和醫療條例都可擇定醫療委任代理人幫病人決定，若代理人非同一人，或決定不同時，如何解決？此外，病主法讓中央主管機關有權公告還有哪些病人也適用，但施行細則僅規定病友團體與醫療機構等可提出建議，未寫明透過何種會議形式，會否變成衛福部說了算？
衛福部醫事司長石崇良回應表示，越晚立醫療決定，越接近現在的意志，以較後期委任的醫療代理人的決定優先，民眾也須循程序變更前面的決定；至於哪些病人適用，討論出草案後，再預告六十天讓各界提供意見。
雙和醫院醫師楊哲銘說，醫療法中沒有醫療委任代理人，醫療委任代理人屬醫療法中所謂的關係人之一，或決定權高於患者的法定代理人、配偶或家屬？石崇良則說，醫療委任代理人決定權，高於醫療法中的法定代理人、配偶或家屬。
台北榮總醫師吳俊穎說，許多疾病在早期不明顯，如何定義沒有行為能力？確診失智前，可能發生的輕微認知或行為障礙，是否算病主法所謂的心智缺損？石崇良說，以臨床醫師判斷為主，醫學或精神鑑定寫明心智缺損，就屬心智缺損。
考量失智者人權，若民眾循病主法決定未來重度失智時，不要管灌餵食，但屆時他表達好餓，此時若不管灌，是否代表失智者生理需求比健康者的意願沒價值？另病主法未考慮退化性失智與血管性失智的差異，後者可能恢復，醫療決定權卻在委任代理人手上，並未比照不可逆昏迷或永久植物人給予觀察期。
亞東醫院神經醫學部一般神經科主任甄瑞興說，針對醫師預期可能好轉的重度失智患者，病主法應給予一定的觀察期。石崇良說，病主法就是因此要民眾預立醫療決定前要先作諮商。
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