全國新冠疫情延燒兩年多，衛福部長薛瑞元長期在指揮中心協助防疫，看到目前「傳染病防治法」有所不足，為銜接明年6月30日到期的「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例」，已成立修法工作小組並展開修法作業，兩大重要修法方向是讓傳染病防治醫療網和隔離檢疫更有彈性。
薛瑞元說，依現行傳染病防治醫療網，全國共22家應變醫院，可將傳染性疾病患者集中收治於專責病房，但面對Omicron疫情，發現病患遍布各地，且疫情初期重症患者多，不可能集中收治於少數醫院，加上新冠病毒與SARS不同，沒有發燒的明顯定義症狀，也完全在有傳染力之前集中收治。
薛瑞元表示，即便要集中收治確診病人，還必須清空應變醫院病房，但部分應變醫院同時也是急救責任醫院，清空病房會排擠其他疾病患者的就醫需求，「這樣是行不通的」。所幸新冠疫情初期於Alpha變異株流行時，由各醫院分散收治確診病人，度過疫情衝擊，修法方向為集中與分散收治並存，因應疫情變化，可彈性處理。
其次是修法調整傳染病確診病人的隔離檢疫方法及流程，薛瑞元說，如傳染病的通報時間、確診病人的隔離措施、隔離通知書發放等，將一併檢視，如Omicron疫情時，一天增加數萬例確診病人，衛生單位於行政上來不及處理，將檢討法規，「不要訂的太死」，目前疾管署已著手清點相關問題清單。
民眾到底何時叮以拿掉口罩？薛瑞元對此笑而不答，但他強調，「對疫情的態度是樂觀的。」目前Omicron仍不斷出現變異株，雖然可能還會有1波疫情，但國內疫情趨勢應接近香港、南韓、新加坡，目前防疫由衛福部次長王必勝擔任指揮中心指揮官，相信「一切都在控制中。」
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