過敏，在人類歷史上早已由來已久，從東方黃帝神農著作，到西方醫學始祖希波克拉底的希臘年代都曾提到，直自2005年，世界過敏組織（WAO）才將過敏性疾病視為全球公共衛生問題。以美國為例，推估過敏人口約3.5至5%，小兒又比成人多，估計有8%。看似少數，但實因過敏議題一直未受重視，引起過敏的原因有許多，其中最不受重視的是食物過敏。
1980年代早期，當時民眾不瞭解此議題，甚至大部分醫師對食物過敏持懷疑態度。近幾年來「食物過敏」現象愈趨明確，研究顯示，35年前真正有食物過敏者約1%，而35年後已達3.5至5%。嚴重食物過敏已成為美國急診室過敏性休克主要原因。過去常認為嬰幼兒時期的食物過敏長大就會好，但愈來愈多延續至成人階段。
距今僅30年，食物過敏人口及嚴重程度明顯提升，顯示環境變遷確實改變人類疾病型態，如同大腸癌、糖尿病等。
食物過敏的關鍵可能在於腸道微生物菌叢。過敏是身體阻隔措施有滲漏，腸道是阻隔外來物質進入人體的最大入口，腸道中本來充滿了各種抗原，如微生物菌叢。
這些菌叢的菌相變化與免疫系統有極大關聯，可以影響甚至幫助調節免疫系統，讓免疫系統健全較不易產生過敏反應，易有食物過敏者，就更需顧好腸道微生物的生長。
但與現代人共生的菌叢已產生極大變化。以抗生素為例，據統計，全世界80%抗生素使用於農業、畜牧業，過度使用僅為了讓動物長肉更快，卻因此讓人類腸道菌相失衡。其他諸如剖腹產、配方奶食用、高油高糖低纖、嗜吃加工食品等，都大幅影響腸道微生物的組態。
再者，一旦過度控制室內溫度、濕度、光線等環境因子，長期下來，不僅限制免疫系統的發展，也限制了微生物多樣化的可能性，甚至共生菌叢被改變後，想要再恢復的能力或時間也會受到影響。
出生以後到3歲是免疫塑型期，也是腸道微生物拓植重要時期。此段時期建立的腸道微生物的結構，終其一生都已大抵確定，因此無須刻意營造無菌的環境，讓其嬰幼兒自然生長，才能建立較健全的免疫機制。
雖目前對過敏仍未有百分百的檢測方法，但「食物過敏原檢測」仍具參考價值，可瞭解自身是否有過多的過敏原；另一方面，針對重度過敏反應的食物採避開或輪替食用，同時補充益生菌、多攝取高纖食物，維持腸道微生物菌叢多樣性，才能避免過敏、發炎、滲漏的惡性循環，始能讓免疫機制重回正常運作軌道。
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