秋冬專案自12月起實施，要求包含國人的所有入境者，皆須檢附3日內核酸檢驗陰性證明，多名立委質疑此舉違憲。中央流行疫情指揮中心則稱「措施無違憲」。南投律師公會前理事長林瓊嘉強調，防疫攸關全民生命侓康，可對個人權利自由限制，認疫情指揮中心採行措施有法律依據，符合憲法第23條法律保留原則，外界指侵犯大法官會議權責，言過其實。
南投律師公會前理事長、台中市政府訴願委員會委員林瓊嘉表示，依憲法第23條規定，憲法規定的人民的自由權利，為增進公共利益所必要者，得以法律限制之。是為法律保留原則。
中央疫情指揮中心秋冬專案，宣布所有入境者皆須檢附核酸檢驗陰性證明，是依據傳染病防治法第48條規定，中央主管機關得就傳染病之危險群及特定對象實施防疫措施。上開所採行措施有法律依據，符合憲法第23條法律保留原則。
COVID-19的邊境管制防治，關係全國人民的生命健康，應尊重專業的判斷，全民健康公共利益在傳染病防制法有授權依據時，自然可以對個人自由權利限制。
是否違憲如果有爭議時，解釋權當然屬於大法官會議，但中央疫情指揮中心認為其依法律授權規定，採取適當的防治措施，並不違憲，應係為其規範措施提出說明，為行政機關之職責，以此說其侵犯大法官會議權責，言過其實。
大法官釋字第558號是針對解嚴後入出境不當限制住居臺灣民眾入出境而解釋(有戶籍不濡入出境審查），與本案無關連性(疾病防治)。
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