指揮中心將隨紓困振興特別條例一路開設到明年6月底，指揮中心指揮官王必勝日前指出，因疫苗、藥品和快篩等緊急使用授權（EUA）都是指揮中心存在才能有法規依據，若取消這些醫療物資就不能使用且必須銷毀。但前疾管局長蘇益仁則表示，指揮中心的成立和EUA是沒有關係的，「不懂他們在講什麼」。
蘇益仁表示，指揮中心成立主要是為了統籌各部會且有一個決策中心，而藥證要不要通過主要在於食藥署，就算沒有藥證，只要有緊急需求，需要「緊急使用」也可由疾管署處理。
他說，緊急使用授權（EUA）的法源來自藥事法，是因應緊急公共衛生情事需要，而非「指揮中心成立」；且指揮中心是SARS後才有的機制，但是緊急使用授權在這之前就有相關辦法存在。
蘇益仁說，當時新冠肺炎疫苗採EUA的方式，主要是因為當時疫情緊急，且沒有可以用的疫苗，但是現在這樣的條件都不存在。就像美國，也在緊急事件後就結束了新冠肺炎疫苗的EUA，BNT疫苗在去年8月已拿到美國正式藥證，莫德納疫苗也在今年年初取得正式藥證。
對於指揮中心硬要留到明年6月，蘇益仁說，因是為了特別預算。當時SARS於2003年7月解散，特別預算還剩下不少，為了消化預算也煞費苦心。現在可能是為了消化紓困條例的特別預算，留到明年6月還可以慢慢消化，而且對執政黨而言「有一筆錢在口袋也不是壞事」。
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