中研院前研究助理案一六八一六確診Delta病毒，指揮中心指揮官陳時中昨證實，實驗室病毒跟確診者病毒株定序相符，判定來源為實驗室，且桌面、門把都採撿到病毒。專家直言，Ｐ３實驗室的環境中不應有病毒，且操作人員有穿防護衣，離開時如何把病毒帶出且染疫，這些疑點都需釐清。
十一月時案一六八一六在實驗室內操作Alpha病毒株，不過感染的卻是Delta。指揮中心專家小組召集人張上淳指出，據調查，實驗室不只有一種病毒株，當時有三人同時操作三種不同的變異株，包括武漢原始株、Alpha變異株及Delta變異株，不排除交互感染，仍需更多客觀數據佐證。
「Ｐ３實驗室怎麼會有病毒，太奇怪了！」台灣感染症醫學會名譽理事長、台大兒童醫院院長黃立民表示，人員戴手套在Ｐ３實驗室中操作病毒，必須在安全操作櫃內進行，手離開安全操作櫃時都要清洗，理論上實驗室內環境是乾淨的，因為病毒被鎖在安全操作櫃中，且人員離開實驗室都要打開紫外線消毒，若環境驗出病毒，代表沒有嚴格遵守操作守則。
長庚大學新興病毒感染研究中心主任施信如說，操作病毒人員都帶雙層手套，並在操作箱內的培養皿進行，若沾到病毒，手套都會放在廢棄桶處理掉，且實驗室為負壓環境，病毒不可能自己飛出去。
施信如指出，如果實驗中病毒不小心潑灑出來，需通報另一組人員來清理，按程序脫除防護衣並沖洗，不可能讓病毒留在環境中。
台大醫院院長吳明賢說，國際研究報告指出，確診者房間內的廁所握把、水龍頭等都可能存在病毒，因此調查確診個案所處的環境汙染狀況，將是一個重點。
至於實驗室中同時進行三種病毒株實驗，黃立民說，實驗室規定，兩種不同病毒株不能在同一實驗室進行，中研院三種病毒株都是新冠病毒，只是亞型不同，並未違反規定。施信如說，同一實驗室有可能同時做三種病毒實驗，只是若將病毒放一起，有交叉感染風險，病毒也可能重新產生排列組合，過程要非常小心。
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