敦睦艦隊爆發新冠肺炎群聚，目前三人確診，同艦隊七百多人全數集中檢疫。新冠病毒對郵輪、軍艦帶來極大威脅，「瘟疫軍艦」在國外皆有前例，美國航空母艦「羅斯福號」傳出逾百人感染，法國「戴高樂」航空母艦逾千人確診。防疫專家表示，軍艦封閉環境、資訊傳遞緩慢，研判軍艦染疫率最高恐達四成。
全球至今已發生多起與船艦、郵輪有關疫情，其中最廣為人知的就是鑽石公主號，全船三千多人中，七一二人確診，確診率高達兩成。台大兒童感染科主任黃立民表示，船艙是危險空間，一群人長期於單一密閉環境，「只要一人確診，就應將整船人員視為確診者處理」。
黃立民表示，軍人生活模式比一般民眾更集中，增加軍艦感染風險；另外，由於軍事高度保密性與上下階層制度，許多資料的傳遞需要層層簽核，但處理傳染病群聚必須與時間賽跑，如今雖處理明快，但未能在患者有症狀的第一時間，即四月初就掌握發病患者狀況，在感染雙重風險下，感染人數恐達三至四成。
林口長庚醫院小兒感染科醫師邱政洵說，「坦白、公開、透明一定是防疫要務」，軍事體系複雜，從最高官階軍官到最基本小兵，再加上不同軍種隸屬不同單位管轄，防疫資訊恐難如實傳達給每個人，「可能讓沒有掌握到消息的人，比較沒有防備之心。」
邱政洵表示，多數傳染病的傳播力，如流感等，即使軍中有群聚也多是散發個案，傳染力皆不如新冠肺炎「狡猾」，初期症狀不明顯，尤其軍艦上以年輕人居多，恐有相當高比率是無症狀感染者，若未及早分艙分流，恐造成疫情大爆發。
一位醫界人士也質疑，軍艦當時為何沒有比照包機入境模式先集中控管，待採檢無虞再放行？其中一名軍校生出現頭痛、嗅覺失靈等症狀時，軍醫是否疏於警覺，以致造成群聚感染？
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