我國去年總死亡人數較前一年增加一點一萬多人，衛福部統計處認為，去年台灣籠罩在疫情威脅下，但並非是總死亡人數增加的主因，歸因人口老化及低溫導致；衛福部並引用經濟學人說法，強調台灣是全球唯二超額死亡呈負數的國家。國內僅引用各國說法，並未自行統計疫情是否超額死亡，學者有不同意見。
「疫情確實可能影響去年總死亡人數，不希望忽略任何死亡，唯有去分析，才知道怎麼防疫。」台大社會學系退休教授薛承泰以二○二○年為基期，考量二○二一年人口結構老化、氣候變遷等諸多因素，再扣掉官方公布確診致死與疑似疫苗接種後的死亡，算出二○二一年不明原因的超額死亡人數，介於六千至七千人之間，約占去年十八萬人的百分之四。
薛承泰指出，這些人可能死於醫療排擠、死於被疫苗誘發疾病，也可能是未確診就死亡的黑數，規模是當年度官方公布確診致死人數好幾倍。
薛承泰表示，他可以接受衛福部沒算這麼清楚，因為計算方式不容易有共識，官方不想給自己找麻煩。若衛福部也可以查清楚《經濟學人》計算方式，也可以直接照著算，不然就是像現在這樣，讓學者專家去說，官方只要默認就好了。
去年死因中，新冠肺炎位居第十九位。衛福部統計處副處長劉訓蓉表示，以經濟學人資料顯示，台灣經歷二波本土疫情，截至到今年五月底以前，台灣疫情並未出現超額死亡，至今仍呈現負數。她說，統計處並非是公衛單位，因此不會計算超額死亡，疾管署相關單位才會統計。疾管署疫情中心主任郭宏偉表示，超額死亡是統計處業務，疾管署並未統計計算。
另外，去年十大死因中，肺炎死亡人數減少百分之一、高血壓增加百分之十七、糖尿病增加百分之十一、慢性下呼吸道疾病增加百分之十；台北醫學大學附設醫院胸腔內科主任周百謙表示，慢性下呼吸道疾病增加，可能是疫情讓下呼吸道疾病的診斷增加，連帶讓比例提高。
台灣高血壓學會名譽理事長王宗道表示，高血壓逐年上升，與服藥遵從性變低有關，他認為與疫情有一定關係，高血壓控制不佳也連帶會增加腦中風或主動脈剝離等情形。
十大死因雖以高齡者為主，但單獨分析年輕族群，一至廿四歲死亡人口以事故傷害居死因居冠；廿五至四十四歲以癌症與自殺居前兩名；四十五歲以上則以癌症與心臟疾病居死因前二名。
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