本年度公費流感疫苗接種比往年延遲兩周，直至10月15日（上周一）才開打，不過民眾接種情形相當踴躍。根據衛福部疾管署統計，一周以來已經施打超過130萬劑，其中有126萬多名成年人已接種，但3歲以下幼兒僅約5.5萬人接種。統計今年10月至昨為止，流感併發重症個案已累計35例，創5年同期新高，但疾管署強調，這與疫苗延遲開打無關，是九月開學後的一波小疫情延續至十月。
疾管署防疫醫師林詠青表示，10月初以來計有35例流感重症個案，逾半數感染A型流感H3N2，其中年紀最小者為中部10個月大女嬰，10月中旬發病，之後竟開始出現抽筋症狀，確診感染H3N2，醫師擔憂併發腦炎，送往加護病房救治，目前病況穩定。
流感重症個案數創5年同期新高，是否因疫苗延期開打？疾管署副署長莊人祥表示，與疫苗開打時程無關，而是因為9月開學後有一陣小流行，該波疫情延續至10月，才導致病例數較往年增加；近日群聚通報件數較開學後幾周明顯下降，但仍有14起校園群聚，以國小為多，另也有國中及幼兒園通報。
公費流感疫苗上周開打後，學齡前幼童接種率較低，莊人祥提醒，流感疫苗接種後約2周才會產生保護力，幼童抵抗力較差，是感染流感的高危險群，應趕在高峰期前接種。
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