邱仲慶的養生之道相當簡單，就是規律作息與運動。20年前因太太林秀娟在衛生署國健局服務時推廣「每日一萬步」，他更是奉行至今，與騎單車成為運動主力。
平常上班日在院區走來走去，常超過5、6千步，下班則到健身房運動、游泳補足，如果太疲累不適合運動，就會以「泡澡」取代，能很快消除疲勞。
他的體力不輸年輕人，每次游泳都能游500公尺，奇美的運動會、公益路跑也都難不倒他，愛騎車的他也參加奇美醫院自行車社團，假日騎自行車同遊放鬆身心。
「運動不求快速、不做高強度的肌肉訓練。」邱仲慶建議，年輕時就要找有興趣的運動，越早養成規律運動習慣，越有益健康，並可延緩老化。
神經外科手術搶救病患，常與死神拔河，需要高度專注、眼手協調及情緒穩定，邱仲慶靠運動培養體力與抗壓性，近年手術量減少、體力負擔降低，但醫院經營、醫護管理與教學用腦壓力大增，因此規律運動還是最好的減壓良方。
邱仲慶平常上午7點上班，下午6點下班，雖然工作忙碌，但作息盡量規律。他幾乎不外食，飲食以清淡簡單為主，不挑食、不過量，在醫院餐廳吃飯時常會看到他的身影。
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