染疫康復後隔一段時間再出現症狀，是「復發」，還是「二次感染」？指揮中心專家會議達成共識，兩周內出現症狀大多屬於原病程復發，超過三個月屬於二次感染；至於三個月內再次驗出ＰＣＲ陽性，在符合一定症狀、病毒量或基因定序為不同病毒株的條件下，將認定為二度感染。
指揮中心代理發言人羅一鈞表示，近期將明列二次感染定義，包括超過三個月以上可列入二次感染通報，以及一至三個月內的判定條件等，並修改通報系統，連動後續自主回報、開藥治療等；若有符合條件個案，在通報系統尚未更新前，可請醫師手動通報，並與地方衛生單位聯繫，補發居家隔離單。
羅一鈞表示，二次感染是最近一次病毒感染後，在三個月後再出現症狀，且ＰＣＲ檢驗發現病毒量回升。目前各國對新冠肺炎二次感染時程定義不同，英國、美國認定三個月以上，歐洲認為六十天以上。羅一鈞表示，二次感染仍可能成為重症，但也要考慮其重複用藥或高齡等用藥風險。
羅一鈞說，三個月內再次感染機會不高，研究發現，感染Omicron BA.1後，二度感染BA.2機率僅萬分之一或三，二次感染機率隨時間增加，但通常不會在短期內出現。
指揮中心專家諮詢小組召集人張上淳表示，二次感染須由醫師判斷，發生時機大多在確診後三個月以上，但確診一至三個月內也可能二次感染，狀況較複雜，若醫師認為疑似二次感染個案，專家建議先通報，由網區防疫醫師及指揮官了解並討論是否需用藥，若確認為二次感染，會當作新個案。
部分確診者治療後又出現症狀，羅一鈞表示，從國外經驗來看，有百分之一至二的確診者，使用抗病毒藥物且症狀改善五天後，經過二至八天又出現症狀，甚至採檢陽性，但由於後續症狀會自行緩解，不建議給予二次抗病毒藥物或其他藥物，無需額外重新隔離，這種情況將稱為「復發」或「竄升」，尚待討論。
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