缺藥（抗生素新藥）、缺人（感染科醫師），且醫療院所抗藥性細菌占比持續攀升，台灣感染症醫學會、台灣感染管制學會呼籲，如果放任不管，情況惡化，到了2050年，台灣每5人就有1人死於抗藥性細菌感染，回到無藥可用的醫療黑暗期。
為此，兩大團體向健保署遞交「抗菌藥物使用暨抗藥性照護品質提升計畫」建言書，希望政府重視感染科缺藥及缺人的醫療窘境，盡快提出應對方案。
台灣感染症醫學會理事長王復德指出，抗藥性細菌問題嚴重，世衛組織今年6月示警未來可能爆發「沉默疫情」（silent pandemic），讓全球醫療進入黑暗時代，不解決的話，將回到沒有抗生素之前的年代。
關鍵在於新冠疫情讓抗藥性細菌變得更棘手，王復德說，這兩三年來，臨床醫師收治發燒患者，無法及時研判新冠病毒或是其他病菌，大都先投以抗生素。
研究顯示，近72%確診者住院時接受抗菌藥物治療，但僅7到8%的確診住院患者、14%加護病房確診者出現細菌或真菌合併感染等問題，形同濫用抗生素。
台灣感染管制學會理事長陳宜君說，近年來食藥署僅審查核准3個抗生素新藥，另4成臨床醫師反映抗生素供給不穩定，其中93.8%醫師被迫改變抗生素療程，使用更廣效或多種抗生素。
除缺藥，更缺人，三總副院長張峰義以「錢少事多，有功無賞，打破要賠」形容國內感染科醫師人力短缺的困境。由於健保並未給付院內感染控制、抗生素管理，加上感染科門診病患不多，影響薪資，感染症專科醫師報考人數逐年下滑。
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