新冠肺炎疫情肆虐近3年，各國紛紛採購疫苗以防堵疫情。但有媒體報導，至今年9月止，政府採購5千多萬劑各品牌疫苗中，已銷毀300多萬劑、約6%．5疫苗過期報銷，浪費公帑約12億元；其中高端報銷5億元居冠。指揮官王必勝今表示，為了超前部署，一定會有疫苗屆效問題，全球各國都有這樣的狀況。前疾管局長蘇益仁則表示，防疫物資的決策關鍵應是人口數，而非成本會計。
根據指揮中心最新統計，到9月15日疫苗數為349．5萬劑，佔已進貨及捐贈總量6576．3萬劑的5%．3。
指揮中心前指揮官陳時中今表示，先前的H1N1也是有大量報廢疫苗，但不能當作浪費，以目前新冠疫苗報廢的數量算很少，在良好的控制下才有這樣的數目。
對於疫苗屆效銷毀，前疾管局長蘇益仁表示，流感疫苗因為有過去接種經驗，因此以人口數約3成購買，但以美國等其他國家為例，都是以人口100%計算購買，甚至超買。
而面對新病毒，因為未知數很多，「國外都很清楚寧可多，不能少」。以美國為例就購買了約5億劑，是其人口的好幾倍。後來也證實，因為病毒一直變異，疫苗保護力有限而不只要打1劑，需要接種到兩劑、3劑。
蘇益仁表示，防疫物資不能夠用常態的物資想法規劃購買，決策點應該以「人口數」思考。雖然每個國家資源不同，但應盡量以人口數的100%計算；或至少要購買6至八成，以達到群體免疫力。
他也表示，疫苗接種還受限於民眾接種意願等因素影響，不可能打得剛剛好。例如當時H1N1時購買1千萬劑國光疫苗，接種到500多萬時發生「劉小弟事件」就無法繼續催種，銷毀約3、4成以上的疫苗。
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