國民黨立委賴士葆調查發現，截至6月底，政府買疫苗花了67億元，其中卻只有10億元採購國際疫苗，質疑剩下4、50億元的預算經費花到哪去了？而外界質疑指揮中心遲不公布疫苗採買價格，是在等待什麼時機？指揮中心指揮官陳時中表示，價格是保密事項，「叫我講價格的，我都認為居心叵測」。
國民黨質疑67憶元的疫苗採購預算花到哪裡，但審計部審計長陳瑞敏回復是「機密」。黨主席江啟臣說，政府的資訊本來就是以公開為原則，況且主計處早就說過疫苗的採購不屬於機密預算。
對於這筆預算編列，陳時中表示，67億編列「我不太了解」，疫苗當然有幾個。但所有買東西都有預算數，還有權責數，還有已經付出的現金流。買了一定的疫苗，到貨沒那麼多，有簽約的、付出去的，使用的現金當然沒到預算數，但很多權責都匡下來了，到貨前會陸續付款。
而針對外界質疑遲不公布疫苗價格，陳時中則表示，現在進貨是我國最大的困難，而所有合約裡面都寫得清清楚楚，價格是保密事項，如果破壞了會影響合約有效性和進貨時程。「請大家理解，不要因為這樣讓進貨受到干擾」。
至於網路流傳泰國相關文件表示，台灣是最早簽約要談購買疫苗，但因受AZ泰國廠產地產能影響，進而導致疫苗延誤到貨。
陳時中表示，「那個文件我沒看過」，事實上我國和COVAX九月底就簽約，十月底跟AZ簽約，更早兩三個月前就談判。
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