防疫旅館變得一房難求，指揮中心預估春節返國人潮約三萬人左右，現又爆發浙江台商疑似防疫旅館感染事件，引起不少疑慮，專家建議，應突襲檢查防疫旅館，現行制度是否含突襲檢查，指揮中心發言人莊人祥僅說，可能跟各縣市管理有關，鼓勵他們有這樣的措施。
高雄市立小港醫院感染內科主治醫師張科指出，指引訂立內容再怎麼完善，最重要的還是落實度，「有些業者查驗合格，但執業時就不落實」，地方衛生單位應該負起稽查責任，採突襲式檢查，並抽查走廊監視器，確認隔離檢疫者是否外出。
台大兒童醫院院長黃立民認為，防疫旅館稽查人力明顯不足，必須體諒指揮中心及衛生單位，因為防疫旅館眾多，實在力有未逮，只要沒人盯著，業者難免鬆散，未依照ＳＯＰ行事；再者，防疫旅館住房應該增加室內空間的外氣循環，不能讓內氣一直循環，才能做好感控措施。
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