國內有感染科醫師認為，入冬以後可能疫情再起，從院內感染開始，指揮中心發言人莊人祥表示，入境感染者確實可能出現「漏網之魚」，所以在社區及醫院，一定要落實保持社交距離，無法保持距離就要戴口罩，相信就可將秋冬新冠肺炎疫情爆發可能性降到最低。
莊人祥說，入冬疫情從院內感染開始，屬於「最壞劇本」，尊重專家意見，但指揮中心防疫重心仍以邊境風險嚴管為主。莊人祥強調，除特殊短期商務來台，其餘入境者全數需居家檢疫14天，但該病毒確實難纏，期滿後仍須自主健康管理7天，外出須戴口罩，避免搭大眾交通工具。
近期頻傳入境檢疫期滿仍驗出病毒陽性者，莊人祥表示，新冠病毒特性為發病前兩天開始可傳染，發病當天感染力最高，發病第十天無傳染力，確實有病例長達80多天病毒檢測仍為陽性，但其實已經不具傳染性。
但仍不可排除病毒潛伏期超過21天可能性，所以莊人祥提醒，民眾一定要在密閉場所帶口罩，避免不小心有未被揪出的感染者走入社區或醫院，造成大型群聚事件，但莊人祥認為，醫院本就需要戴口罩，有基本防護，應可將感染風險降低。
林口長庚紀念醫院副院長、兒童感染科教授級主治醫師邱政洵表示，臨床已出現不少氣管炎、上呼吸道感染、腺病毒感染，甚至有些因為感冒引起肺炎的案例。
疫情流行初期，國人幾乎都能尊循戴口罩、勤洗手等規範，也讓腸病毒、流感幾乎被消滅，當時還有專家笑說「小兒科要沒生意了」，但現在這些疾病慢慢回來了，顯示民眾近期真的是鬆懈了，口罩戴得不如三、四月這麼緊。
邱政洵表示，臨床的現象是一大警訊，無論是上呼吸道感染、腺病毒感染或是流感，症狀幾乎與新冠肺炎一模一樣，發燒、咳嗽，第一線根本無力辨別，台灣幾乎沒有病毒，能安心朝過往經驗判定感染性疾病，倘若，發生社區感染，在秋冬這個季節，等於同時宣布醫療體系的崩壞。
台灣目前仍採取嚴守邊境的策略，不過目前仍有零星的境外移入確診個案，加上無法排除無症狀感染者的存在，民眾若是沒有在秋冬把口罩戴好、手洗好、社交距離保持好，潛在於社區的個案碰上免疫力低的民眾，就可能讓社區感染一觸即發。
邱政洵表示，長庚醫院感控持續不敢鬆懈，戶外篩檢站也不敢撤，也呼籲國人千萬不要鬆懈，出入公共場所一定要戴口罩，手一定要徹底洗乾淨。
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