每年6、7月有大批遠洋漁船載回魷魚、鮪魚等漁獲回到台灣，船員人數總計達上千人，需要執行一人一室的新冠肺炎檢疫措施，靠泊在高雄的漁船數量最多，今首艘遠洋漁船抵達高雄前鎮船上有48名非本國籍船員，分別為印尼籍29人、菲律賓籍18人及1名中國籍人士，再加上4名台灣籍船員，皆需執行隔離檢疫14天。
首艘遠洋漁船返高雄港，高雄市市長韓國瑜到場與船員熱情握手，面對這個舉動，指揮官陳時中表示，「當然不建議這麼做」，給予從遠洋回來國人溫暖很好，但近距離接觸是不好的。據了解韓與船員兩方手部消毒過，安全應沒問題。但居家檢疫者近距離接觸與握手應避免。
中央流行疫情指揮中心5月14日宣布，已取消漁船返港前30天無接觸史漁工就可免原船檢疫的判定，只要下船入境就必須要隔離檢疫14天，如果船上不能滿足一人一室規定，船東就要去找旅館來滿足這個要求。
指揮中心副指揮官陳宗彥今早也親自南下高雄視察漁船檢疫，下午2時趕回台北參加指揮中心例行記者為，陳宗彥表示，整個團隊加上高雄市衛生局海洋局在現場作完整流程，船隻停泊碼頭後，每名船員都需進行手部、腳部清消，再由衛生主管機關詢問身體狀況。
陳宗彥說，船員在完成證照查驗、入境許可，才會進入防疫旅館，讚許今天遠洋漁船檢疫過程順暢，每年遠洋漁船回台時間約二波，船員人數各有一兩千人，魷魚船返台集中在6月初到6月中，鮪魚船則集中在6月中到7月底，另外有零星捕小管的漁船回台。
遠洋漁船靠泊地點主要在高雄，其次是宜蘭和屏東。陳宗彥表示，今起到6月至7月將在有4050名遠洋漁船人員入境台灣，高雄防疫旅館原本只有800多間，目前已擴增至2800多間，預估最高峰一天需要2500間，應足以應付船員人數。進入防疫旅館後也會落實每日健康狀況管控。
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