我國首起軍艦群聚感染，恐掀起我國新一波疫情；而三名確診官兵染疫時間點啟人疑竇，多名專家皆認為從時間序來看，不太可能是在帛琉染疫，分析二種較為可能染疫的時機，一種是艦上有無症狀感染者，另外一種可能為軍艦9日靠航後，恐有接觸到感染者，無論何種情況都對台非常不利。
台大公衛學院副院長陳秀熙表示，指揮中心將軍艦群聚目前最可能的感染源指向帛琉，他認為此方向可能性最低，海軍3月12到15日停靠帛琉，若是染疫早就發病，不可能等到4月12日才出現症狀。
他最擔心是軍艦於9日靠航台灣，等待下船的6天期間內，曾有人下船或是有人上船，進而接觸到感染源；他說，因為這期間接觸到感染源才會讓官兵在4月12日發病，該感染源恐怕是軍艦以外的人，恐怕正在社區內趴趴走，這是令人最為擔心的事。
林口長庚醫院教授級主治醫師、兒童感染科主任黃玉成則認為，應該是軍艦上有無症狀感染者的機率比較高，他說，依照目前新冠肺炎患者從染疫後發病，最常見的潛伏期時間為5到7天，最長則是14天，偶爾會有21天才發病，但極為少數。
黃玉成說，案396，4月12日出現症狀，用常見的潛伏時間回推，應該是在4月5日左右染疫，當時人正在軍艦上，因此才推測是軍艦內有無症狀感染者，或是該名染疫者症狀極為輕微至今都未被發現。
黃玉成說，他也很擔心軍艦的染疫狀況，若是軍艦內有無症狀感染者，參考鑽石公主號的採檢結果，當時有五成的旅客沒有症狀，雖然後續有部分發病，但採檢陽性後續持續無症狀者占二到三成；他也非常擔心敦睦艦隊恐會有同樣的情況發生。
不過，他認為，目前已經召回採檢700人，近期就能解除疑惑，他也說，現在對700人採檢也不一定真的驗得到，有些人恐怕已經自癒，恐需要加驗體內抗體才能如實還原真相。
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