一位曾在台灣公開演奏的澳洲籍音樂家，回國後發現感染新冠肺炎確診；然而兩周前入境台灣時，卻查無疫區旅遊史，因此在排練與表演過程完全沒有啟動防疫措施，讓不少人心驚。這類病例的出現，其實就印證了指揮官陳時中所說的「第二波疫情已經來襲」。
第一、第二波疫情的最大分野在於，先前病毒主要從中國湖北散播出來，而過了兩個月不到，全球每日新增病例最多的區域已換成南韓、義大利與伊朗等國。台灣很幸運在第一波疫情裡沒有出現嚴重本土感染，接下來必須續防病毒第二波攻擊，而要守住戰果，第一步便是探究先前的成功因素。
陳時中說「中國大陸可能為了拚復工而使疫情減緩」，然而台灣能擋住第一波疫情，最大原因就是中國大陸疫情被成功圍堵了，否則病毒將如潮水湧來。雖然中國大陸第一時間隱匿疫情，但歐美媒體公認，後來他們靠著其他國家難以執行的強力隔離措施，為歐美國家爭取到一個月的防疫時間。至於台灣，因ＳＡＲＳ的創傷經驗，對疫情提高警覺，老早關閉中港澳邊界，而且民眾大都自行戴口罩，配合政府減少出國與團體聚會。
除了台灣，香港、新加坡也在一小波社區傳播後疫情宣告穩定，而東南亞國家與目前處於夏秋季節的紐澳，病例總數也相對較少，因此漸漸有人認為，雖然新冠病毒可在溫熱氣候生存，但致病力可能較差。此外，先前認為新冠肺炎的致死率為二％，但從中國大陸非湖北省分、鑽石公主號，以及南韓這些廣泛檢測病毒的區域來看，比較可靠的數字應該是○．五到○．八％，也就是稍高於流感。以上種種都說明了，新冠肺炎雖然不容小覷，但也沒有那麼可怕。
台灣官方目前仍使用「武漢肺炎」這樣的名稱，其實第二波疫情既不是來自武漢，也不一定導致肺炎，應比照世衛建議改成「新冠病毒疾患」。以感染源頭來說，先前台灣靠旅遊史來做病例通報，現在已經無效，如果拘泥於健保卡旅遊註記，只會造成防疫漏洞。
以感染症狀來說，先前以為重症約廿％，其實若大規模檢測便會發現，此數字顯然高估了。未來如果發生大規模社區傳播，防治方向應從防堵改為減害，也就是負壓隔離病房留給急重症，其餘只需單人病房，甚至居家隔離便可，不至於癱瘓醫療量能。此外，禁止大型集會與口罩政策，都可視情疫情調整。
台灣在第一波防疫裡獲得國際稱道，成防疫大國，未來面對第二波疫情，應以謹慎從容取代恐慌疑懼。先前強調自救才能救人，如今疫情相對穩定，台灣社會應冷靜思考，既然想要加入世衛，是否可對其他國家捐助防疫物資，或提供防疫經驗，以證明台灣能對全球公衛做出貢獻。
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