醫學界現在有1個新的理論為「腸腦軸線」（Gut-Brain axis），這條腸腦軸線並非一條真正的線，而是大腦與腸消化道之間的一道溝通橋樑，腸腦軸線是由腸道菌透過迷走神經，連結大腦的感知系統構成的。腸道菌集結腸道中的訊息，最後透過腸腦軸線傳遞到大腦，因此科學家認為「腸道菌」健康與大腦健康有關係，而且兩者是連動的。
不管是巴金森病的藥物吸收，或是其它藥物，吸收的位置都是在人體的腸道，經由血液運送到大腦。有研究顯示，有些人的腸道中會產生一些「毒蛋白」，如alpha-突觸核蛋白(α-synuclein)，這種毒蛋白在黑質細胞內逐漸堆積形成路易氏體，是巴金森病的主要病理特徵。如果在大腦中廣泛形成alpha-突觸核蛋白，會引發路易氏體失智症；如果這種毒蛋白在腸胃道中產生，透過迷走神經就可能被送到大腦，引起巴金森病。
因此，開始有論述指出，只要降低腸道alpha-突觸核蛋白的產生，就可能避免巴金森病，甚至開始推廣「用好菌」抑制腸胃道產生這種毒蛋白。但至今仍在理論階段，雖已證實alpha-突觸核蛋白是最重要造成巴金森病的原因，仍無法確認服用益生菌可抑制此種毒蛋白的產生。
益生菌僅被證實可以改善便祕，幫助腸胃道蠕動等，如果巴友有此改善需求，才建議吃。益生菌可在晚餐之後到睡前這段期間服用，原則上是與藥物間隔1至2小時，能避免干擾其它藥物的吸收。
看報導說腸道是人的第2大腦，兩者隨時連動，那巴友服用益生菌會對病情有幫助嗎？
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