國內一項長達20多年追蹤研究發現，與一般人相較，C肝感染者在腦血管病變、腎臟病、糖尿病等罹病風險偏高，如罹患攝護腺癌、甲狀腺癌，死亡率更分別為一般人的4倍、11倍。
研究主持人陽明大學臨床醫學研究所副教授李美璇推測，應與C肝病毒引起全身性發炎反應有關，長期下來，影響了感染者的免疫反應。建議C肝感染者，應定期抽血篩檢RNA，如為陽性應該立即接受治療，越晚治療，不僅療效較差，死亡率偏高，醫療成本也較高。
李美璇率領的研究團隊，1991年展開C肝感染者社區長期追蹤世代研究，收案對象多達兩萬多名C肝患者，觀察受試者癌症發生率及死亡情況，再比對健保資料庫、衛福部癌症登記、以及死亡檔案等多項資料後發現，與無感染C肝病毒者相較，C肝患者在的腦血管病變、腎臟疾病、以及糖尿病等風險上明顯較高。
這項跨世代研究發現，在肝癌以外的許多癌症，C肝患者罹患率及死亡率均明顯偏高，以甲狀腺癌為例，一般人罹癌死亡率僅1%，但C肝患者卻高達11.8%。
此外，研究也發現，C型肝炎感染者如果拖延治療，不僅大幅增加肝臟的併發症，且大幅增加死亡率，如拖延十年才治療，引發末期肝病與致死率將提高四至五倍。
高醫內科教授戴嘉言指出，C肝口服新藥問世後，感染者能在副作用極低、治療時間短等情況下，清除C肝病毒，政府應該早日擬定C肝防治及治療策略，能省下龐大的後續治療費用。
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