中醫住院醫師納勞基法，雖然多了保障，卻可能影響未來受訓名額減少。由年輕中醫師組成的台灣中醫執業環境改革協會表示，我國醫療院所自訓自用容額長期不足，導致四成中醫住院醫師雖與診所有兼診的雇傭關係，但絕大多數時間卻在其他醫療院所接受無薪「代訓」，晚上再回診所看診賺錢，但這些診所未來可能因勞基法減少聘雇。
為讓年輕中醫師接受較完整的臨床訓練，衛福部訂有中醫醫療機構負責醫師訓練計畫，103年後畢業且領有中醫師證照的年輕中醫師，由中醫醫院或教學醫院進行兩年培訓，醫院可自訓自用，其他中醫診所也可以委託代訓。
四成中醫住院醫師委外代訓
衛福部中醫藥司統計，國內每年畢業後願意投入中醫人數約220人，而108年有480名中醫住院醫師受訓中，已可滿足兩年約440名的需求。這480人當中，有四成是診所委外代訓，包括171人由醫院代訓、27人由診所代訓。
衛福部中醫藥司技士陳慧馨表示，為保障這群醫師9月起的工時與兼診賺錢權益，衛福部106年頒布住院醫師工時指引，規範這批醫師受訓時間與診所兼診時間均納入工時計算，每天不能超過10小時；另規範他們在醫院受訓時間中，能有三個診的時間可回診所兼差看診。
不過台灣中醫執業環境改革協會理事長蔡令儀表示，這些措施實務效益有待觀察，因衛福部頒布指引，能讓定期接受評鑑教學醫院產生壓力，診所則無遵守誘因。
蔡令儀表示，對診所而言，過去僅需負擔這批醫師的看診薪水，未來不僅要嚴格計算工時、超時還要給加班費，另須提撥6%退休金等，「可以合理預期，診所不會想負擔這些麻煩。明年起這類委託醫院代訓的診所容額，很有可能大幅下修，影響年輕醫師受訓權益」。
