原定6月15日為大規模接種疫苗施打日，指揮中心與各縣市衛生局開協調會，晚間突宣布會將疫苗提前送到位，最快可於明日提前施打，然而此舉卻引發各縣市抗議「太急促」，稍晚指揮中心定調，因疫苗到貨時間及各縣市政府預備狀況不一，強調原則上仍以6月15日開打為原則。
中央流行疫情指揮中心表示，下午行政院秘書長李孟諺、指揮中心社區防疫組組長薛瑞元與各縣市政府衛生局召開「COVID-19疫苗接種作業推行協調會」，針對日本捐贈的AZ疫苗開打重點，將交由地方衛生局自行決定，可透過鄰里長或各縣市衛生局通知施打，民眾也可至合約醫療院所及社區接種站接種。
指揮中心指出，75歲以上長者(含65歲以上具原住民身分者)施打，只要為民國35年12月31日(含)以前出生者，或具原住民身分之證明文件且為民國45年12月31日(含)以前出生者，均符合接種資格。同時，75歲以上長者，不限其居住地或戶籍地，均可就近完成接種作業。
各地方政府的疫苗接種策略不同，大部分縣市採預先造冊、由民政單位通知方式辦理，另有部分縣市採用院所預約方式，宜加速擴充電話線路及服務人力，或進行年齡分流預約接種，使施打作業更為順暢，同時要求請地方衛生機關每日確實將接種名冊上傳，以利及時掌握接種進度及疫苗撥配相關事宜。
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